Το ΝΙΜΤΣ έχει ως κύρια αποστολή την παροχή νοσοκομειακής περίθαλψης, θεραπείας, εργαστηριακών εξετάσεων, χειρουργικών επεμβάσεων και περίθαλψης γενικά σε δικαιούχους και λοιπά πρόσωπα, όπως προκύπτουν από τις διατάξεις των παραγράφων Α΄ έως και Ε΄ του άρθρου 2 του ΑΝ 1137/1946, του άρθρου 1 του Ν.3818/1958 και του άρθρου 1 (παρ.1α) του ΠΔ 485/1987.
Δικαιούχοι Νοσηλείας: Οι δικαιούχοι νοσηλείας του Ιδρύματος, συμπεριλαμβανομένων και των μελών οικογενείας αυτών [σύζυγοι, γονείς, τέκνα (προστατευόμενα μέλη) και συγγενείς εξ αγχιστείας α΄ βαθμού], καταβάλλουν κράτηση υπέρ ΝΙΜΤΣ και αναλύονται, όπως παρακάτω:
• Αξιωματικοί και Ανθυπασπιστές εν ενεργεία του ΣΞ.
• Αξιωματικοί και Ανθυπασπιστές εν αποστρατεία του ΣΞ και της ΠΑ.
• Αξιωματικοί και Ανθυπαστυνόμοι εν ενεργεία και εν αποστρατεία της ΕΛ.ΑΣ και της τέως Χωροφυλακής, εφόσον τυγχάνουν μέτοχοι και μερισματούχοι, αντιστοίχως, του ΜΤΣ.
• Αξιωματικοί και Ανθυπασπιστές εν αποστρατεία της τέως Χωροφυλακής.
• Ορφανικές οικογένειες των δικαιούχων των παραπάνω περιπτώσεων, εφόσον και για όσο χρονικό διάστημα λαμβάνουν σύνταξη.
• Μόνιμο προσωπικό του ΜΤΣ.
Λοιπά Πρόσωπα: Σύμφωνα με την παράγραφο Ε΄ του άρθρου 2 του ΑΝ 1137/1946, λοιπά πρόσωπα καθίστανται δικαιούχοι περίθαλψης από το ΝΙΜΤΣ, κατά περίπτωση, κατόπιν έγκρισης του ΔΣ και μέχρι συγκεκριμένου αριθμού κλινών. Με το υπ’ αριθ.1303/5/23-05-2019 Πρακτικό ΔΣ/ΝΙΜΤΣ, το Διοικητικό Συμβούλιο μεταβίβασε την υπόψη αρμοδιότητά του στο Γενικό Διευθυντή και τον Υποδιευθυντή του Ιδρύματος, σε περίπτωση απουσίας ή κωλύματος του πρώτου εξ αυτών»