Το Εργαστήριο Μοριακής Διάγνωσης του ΝΙΜΤΣ, αποτελεί το μοναδικό Εργαστήριο σε στρατιωτικό νοσοκομείο, το οποίο ανταποκρινόμενο στις ανάγκες αξιόπιστης και έγκαιρης διάγνωσης της νόσου COVID-19, προχώρησε έγκαιρα με την έναρξη της πανδημίας στην προμήθεια και διενέργεια της μοριακής μεθόδου ανίχνευσης του ιού, κατορθώνοντας να είναι το μόνο που επιτυγχάνει την ταυτοποίηση 5 μοναδικών γενετικών θέσεων στο RNA του ιού SARS-CoV-2: τα γονίδια Ε, Ν, S, RdRp και ORF1ab, με ευαισθησία ανίχνευσης τα 3 αντίγραφα ιικού RNA για κάθε αντίδραση.